Foligno a été fondée par les Ombriens dans la période préromaine (probablement VIIIe siècle av. J.-C.). Elle fut conquise par les Romains après la Bataille de Sentinum en 295 av. J.-C., recevant le nom de Fulginiae de l’ancien culte de la déesse Fulginia. Foligno récupéra et a continué de croître, en fin de compte obtenant le statut de ville libre en 1165 grâce à l’empereur Frédéric Barberousse.
Lorsque Corrado Trinci s’est retourné contre l’autorité papale, le Pape Eugène IV a envoyé une force contre Foligno en 1439, dirigée par le Cardinal Giovanni Vitelleschi. Les habitants ont ouvert leurs portes et Corrado fut décapité en 1441 dans le Château de Soriano.
Par la suite Foligno a appartenu aux États Pontificaux jusqu’en 1860, à l’exception de l’Époque Napoléonienne, quand elle faisait partie de la République Romaine (1799), puis du Royaume d’Italie (1809 - 1814).